Амідаза (AMD)
Ферменти:Є макромолекулярними біологічними каталізаторами, більшість ферментів є білками
Амідаза:Каталізують гідроліз різних ендогенних та чужорідних аліфатичних та ароматичних амідів шляхом перенесення ацильної групи у воду з утворенням вільних кислот та аміаку. Гідроксамові кислоти та інші органічні кислоти широко використовуються як ліки, оскільки вони входять до складу факторів росту, антибіотиків та інгібіторів пухлин. Амідази можна розділити на ацилази R-типу та S-типу відповідно до стереоселективності каталізатора.
Окрім каталізації гідролізу амідів, амідаза також може каталізувати реакції переносу ацилу в присутності косубстратів, таких як гідроксиламін.
Амідази з різних джерел мають різну субстратну специфічність, деякі з них можуть гідролізувати лише ароматичні аміди, деякі - лише аліфатичні аміди, а деякі - α- або ω-аміноаміди. Більшість амінів мають хорошу каталітичну активність лише для ациклічних або простих ароматичних амідів, але для складних ароматичних сполук гетероциклічні аміди, особливо аміди з орто-замісниками, зазвичай мають низьку активність (лише деякі ферменти демонструють кращі каталітичні ефекти).
Каталітичний механізм:
| Ферменти | Код продукту | Код продукту |
| Ферментний порошок | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | набір з 19 амідаз, по 50 мг кожна 19 шт. * 50 мг/шт., або інша кількість |
| Скринінговий набір (SynKit) | ES-AMD-1900 | набір з 19 амідаз, по 1 мг кожна 19 предметів * 1 мг / предмет |
★ Висока субстратна специфічність.
★ Сильна хіральна селективність.
★ Висока ефективність перетворення.
★ Менше побічних продуктів.
★ М'які умови реакції.
★ Екологічно чистий.
➢ Скринінг ферментів слід проводити для конкретних субстратів через специфічність субстрату та вибирати фермент, який каталізує цільовий субстрат з найкращим каталітичним ефектом.
➢ Ніколи не контактуйте з екстремальними умовами, такими як: висока температура, високий/низький pH та органічні розчинники високої концентрації.
➢ Зазвичай реакційна система повинна включати субстрат, буферний розчин (оптимальний pH реакції ферменту). Косубстрати, такі як гідроксиламін, повинні бути присутніми в системі реакції переносу ацилу.
➢ AMD слід додавати останнім у реакційну систему з оптимальним pH та температурою реакції.
➢ Усі види AMD мають різні оптимальні умови реакції, тому кожен з них слід додатково вивчити окремо.
Приклад 1(1):
Гідролізна активність до різних амідних субстратів
| Субстрат | Конкретна діяльність мкмоль хв-1mg-1 | Субстрат | Конкретна діяльність мкмоль хв-1mg-1 |
| Ацетамід | 3.8 | ο-ОН бензамід | 1.4 |
| Пропіонамід | 3.9 | p-ОН бензамід | 1.2 |
| Лактамід | 12.8 | ο-NH2бензамід | 1.0 |
| Бутирамід | 11.9 | p-NH2бензамід | 0,8 |
| Ізобутирамід | 26.2 | ο-Толуамід | 0,3 |
| Пентанамід | 22.0 | p-Толуамід | 8.1 |
| Гексанамід | 6.4 | Нікотинамід | 1.7 |
| Циклогексанамід | 19,5 | Ізонікотинамід | 1.8 |
| Акриламід | 10.2 | Піколінамід | 2.1 |
| Метакриламід | 3.5 | 3-фенілпропіонамід | 7.6 |
| Пролінамід | 3.4 | Індол-3-ацетамід | 1.9 |
| Бензамід | 6.8 |
Реакцію проводили у 50 мМ буферному розчині фосфату натрію, pH 7,5, при 70 ℃.
| Аміди | Гідроксиламін | Гідразин |
| Ацетамід | 8.4 | 1.4 |
| Пропіонамід | 18.4 | 3.0 |
| Ізобутирамід | 25.0 | 22.7 |
| Бензамід | 9.2 | 6.1 |
Реакцію проводили у 50 мМ буферному розчині фосфату натрію, pH 7,5, при 70 ℃.
Супутні концентрації реагентів: аміди, 100 мМ (бензамід, 10 мМ); гідроксиламін та гідразин, 400 мМ; фермент 0,9 мкМ.
Приклад 2(2):
Приклад 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S. та ін. Екстремофіли, 2001, 5:183-192.
2. Го Ф.М., Ву Дж.П., Ян Л.Р. та ін. Процесна біохімія, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Чжен Р.К., Цзінь Дж.К., Ву З.М. та ін. Біоорганічна хімія, 2017, Доступно онлайн 7.
